محققان دانشگاه ITMO (دانشگاه ملی تحقیقاتی در سنت پترزبورگ روسیه)موفق به طراحی نرم افزاری شدند(نرم افزار MetaFast) که قادر است مقایسه ای بین DNA های میکروارگان(میکروب یا باکتری) های موجود در هرمحیط به عمل آورد. در نتیجه با کمک این نرم افزار میتوان باکتری های موجود در نواحی مختلف بدن هر فرد بیمار با فرد سالم را مقایسه نمود. با تک میکس همراه باشید.
بر این اساس این الگوریتم طراحی شده میتواند عاملی برای کشف عوامل بیماری زای ناشناخته قرار گیرد.هریک از جانداران داری یک ژنوم هستند که همان نسخه ی ژنتیکی انحصاری آن می باشد, علاوه برآن هر موجود داری یک متاژنوم نیز هست و این ها ساختار DNA میکروارگان های موجود در هر محیط مثل محیط های باکتریایی, ویروسی یا دارای قارچ را تشکیل می دهند.این متاژنوم ها هستند که نشان دهنده ویروس ها می باشند.
به گفته سرپرست محققین بخش آزمایشگاه تکنولوژی کامپیوتر دانشگاه ITMO این نرم افزار که متافست (MetaFast) نام دارد قادر است مقایسه سریعی بین حجم عظیمی از میکروارگان های هر ناحیه صورت دهد که ممکن است پزشکان را قادر به شناسایی میکروارگان های بیماری هایی نظیر دیابت و یا عوامل زمینه ساز آن سازد.همچنین این برنامه میتواند مسیر مطالعه زیست شناسان را به سوی کشفیات و کمک به گسترش و توسعه روش های درمانی و دارویی روشن سازد.

یکی از مزایای اصلی این برنامه این است که آن را قادر به کار با محیط هایی می کند که در آن محتویات ژنتیکی هنوز مورد مطالعه قرار نگرفته است. دمیتری الکسیو سرپرست پروژه و رییس بخش لابراتورا بیولوژیکی موسسه فیزیک و تکنولوژی مسکو MIPT می گوید “رویکرد توسعه یافته جدید ما اجازه می دهد تا به دو کار بپردازیم – پیدا کردن تمام توالی دی‌ان‌ای ممکنه ، حتی اگر آنها قبلا ناشناخته بودند (برنامه، آنها را از قسمتی از ژن جمع آوری می کند )، و در همان زمان شناسایی الگوهای متاژنومیکس که یک بیمار از دیگری تشخیص می دهد .

نرم افزار MetaFast ثابت کرده است که در مطالعه متاژنوم های نادر و کشف نشده بسیار موثر است. به عنوان بخشی از این مطالعه، دانشمندان متاژنوم تعدادی از بزرگترین دریاچه های جهان را آنالیز کردند. بدون هر گونه اطلاعات در مورد نمونه میکروبی از دریاچه ها، برنامه شباهت ژنتیکی بین نمونه هایی که از نظر ترکیب شیمیایی نزدیک بودند را پیدا کرد .

منبع